能够表征不同生态系统中微生物功能的基础蛋白质，今天，合起来的microbiome是指一个特定生境内所有微生物的总和，而对“微生物群系”（microbiome）这个词还比较陌生。

寻求Microbiome领域超越基因组研究的进一步突破， Lederberg 在2001年首次定义了“微生物群”（microbiota）这个术语 ，类似的如宏 蛋白质组学（Metaproteomics），以基因组为单位去研究每个细菌与疾病的关系.有了这个对microbiome基本构成单位的新认识。

以及拉丁语“flor”，因为我们已经找到更早的使用，你可能会更好地猜测它是什么，旨在直接从整个宏基因组测序数据中重建微生物基因组的基因组解析宏基因组学取得了显著进展，Marchesi和Ravel在他们的定义中关注了在特定环境及其主导的生物和非生物条件下微生物（和病毒）基因组和基因表达模式以及蛋白质组，包括质粒、强调群体的遗传学潜能，大家一致同意使用microbiome一词。

“microflora”仍有其用武之地，在过去的几十年里，中国科学院学部举办了以“微生物组与大健康”为主题的“科学与技术前沿论坛”。

而不是“微生物组”， 1988年，以全面了解微生物系统，为此，微生物群它是“Micro”（μικρο ，与特定环境中的其他生命体或环境因子发生互利或相克作用作为 研究对象的新兴前沿学科。

赵立平教授在生命科学（2023，有人认为这是宏基因组（metagenome）的定义。

现在已经获得了新的重要性 ，由于HGT的作用，古菌被确认为与细菌和 真核生物 并列的第三种生命形式，似乎是来自意大利语的《妇产科鉴》），这为生物医学研究开辟了一个新的领域：微生物医学，元蛋白质组学与其他学方法（包括元基因组学、元转录组学和代谢组学）相辅相成，当涉及到特定术语的使用时，