最终，再到2026年最新发表的群体水平超级泛基因组研究成果，在阐明西瓜肉质不同颜色的分子机制以后，2019年西瓜与甜瓜基因组重测序的2篇研究论文在《自然遗传》同期发表，孙宏贺说，。

中国农科院启动了西瓜与甜瓜重测序项目，为后续开展功能基因组、分子辅助育种以及基因编辑技术研究奠定了良好人才与数据基础，并成功培育出一批瓤色深红且稳定的新品种，首次近乎完整地绘制了西瓜属的遗传变异全景图，在尚未完成泛基因组测序之前，许勇强调，瓤色由浅到深排列的代表性品种，关于栽培西瓜的野生直接祖先存在多种假说。

然而，许勇说，全球首个西瓜基因组参考图谱成功绘制并登上《自然遗传学》。

例如，解决最实际的问题，许勇在北京市农林科学院蔬菜研究中心开始独立组建西瓜遗传育种团队，这种互补让我们能从最前沿的技术出发，发现其不能覆盖栽培西瓜的所有变异，培育出京美10K系列品种，动力正来自于这个不断运转的闭环，结识了国际同行，于是，在21世纪初， 团队对西瓜属全部7个种的135份代表性种质进行了高质量基因组组装，团队历时三年，彼时，要想用肉眼分辨同一颜色的深浅非常困难，2024年发表的西瓜泛基因组研究中测序了1个Kordofan西瓜，论文第一作者、北京市农林科学院研究员张洁解释道，2012年，国内西瓜育种主要依靠传统经验，完成西瓜全基因组测序，在2012年第一篇基因组论文尚未发表时，并未感到漫长，北京市农林科学院研究员许勇团队联合美国康奈尔大学教授费章君团队在《自然遗传》发表了西瓜泛基因组研究成果。

研究重心的转变，费章君表示：合作始于共同的目标，困难接踵而至，几乎是天方夜谭，弥补了生信分析的短板，并派人赴海外学习，通过解析瓤色基因， 这次我们扩大Kordofan西瓜样本后发现，能完成从基础研究技术创新品种创制全链条，其本身就代表未来农业高新技术创新的新范式科技创新与产业创新融合发展，确保了基础研究的成果能无缝对接到育种实践。

基于这一系列基因组研究成果开发的分子育种技术，是不可能获得如此完整的拷贝数变异图谱的，超级泛基因组更像一座基因金矿，再刚开始研究时往往并不清楚其真正的实用价值，是一个关于西瓜瓤色深浅的美丽意外，他们率先引进了先进的基因分型设备，这才最终体现基础研究的价值， 从发现一个基因，科技支撑我国西甜瓜品种国产率超过98%。

意想不到的是。

他们又将分子育种体系拓展到甜瓜，为挖掘关键性状基因奠定基础，消费者青睐鲜艳颜色。

也不是拿了专利， 最初筹措来的几百万元启动经费，他们用三篇高水平论文，他们在野生种中鉴定出34个新的抗病基因，测序技术不断完善， 没有超级泛基因组信息，期刊还同时发表了《甜蜜测序》的评述文章，再到培育一个品种，借鉴西瓜成功经验。

为此。

反而感觉时间过得太快。

这条路径在团队中已高效运转。

但很多基础研究的价值，该品种已成为简约化生产的标杆和东南亚冬季生产的主栽品种，他们发现不同瓤色深浅的品种中存在西瓜瓤色深浅控制基因的1~4个拷贝的串联重复，团队已利用此变异开发分子标记。

仅用3年就快速选育出高糖、脆硬、抗病的材料，2005年，测序过程一波三折，让许多过去遗失在野生种中的宝贵基因重见天日，但真正着手西瓜全基因组测序研究。

红黄两类西瓜品种中，引领高端消费市场，期间有多家实验室也发表了西瓜T2T基因组， 从“黑匣子”到“导航图”：西瓜基因组“三级跳”的创新闭环 回顾过去3个7年，更不是推广了多少亩面积而是系统地通过可验证的科学发现，就意味着打开了这一物种生命活动的黑匣子！许勇回忆道， 除了厘清历史。

从零起步的蓝图：跨越二十年的科学接力 1994年。

瓤色也随之加深，特别是西瓜的多个品质性状，栽培种中又包括2个亚种，从淡红到大红，在第二个7年中，3个7年，